خامنه از گذشته با پدیده مهاجرت جمعیت روبه‌رو بوده‌است؛ به گونه‌ای که جمعیت این شهر از ۴۸۰۰ نفر در سال ۱۳۳۵ خورشیدی به 3056 نفر در سال ۱۳9۵ خورشیدی کاهش یافته‌است. مردم خامنه پیرو مذهب شیعه دوازده ‌امامی بوده و به زبان ترکی آذربایجانی سخن می‌گویند.